股东变更合同有效的法律依据主要是《中华人民共和国公司法》的规定，即股东持有的股份可以依法转让。这意味着，在符合法律规定的条件下，股东之间签订的变更合同是有效的。若股东在变更过程中未遵循相关法律程序，可能会导致合同无效，进而产生股权纠纷和法律风险。
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